科属不同、形态特征不同等。
1、科属不同：小叶赤楠属于桃金娘目、桃金娘科、蒲桃属；小叶黄杨属于无患子目、黄杨科、黄杨属。
2、形态特征不同：小叶赤楠的枝条干枯细瘦，嫩枝呈红褐色有4棱。小叶黄杨的枝干呈圆柱形，灰白色，小枝四棱形，被短柔，叶片革质，阔椭圆形、阔倒卵形、卵状椭圆形或长圆形。
1、嫩芽不同：赤楠的嫩芽为淡红色，黄杨则为绿色。2、枝干形态：赤楠的枝条比较干枯细瘦，黄杨的树干更加枯皱。3、功能用途：赤楠是常用的盆景制作材料，黄杨四季常青，可以用于园林和木雕。4、养殖方法：生长期间要注意多浇水。
1、嫩芽不同
赤楠和黄杨的嫩芽颜色不同，其中赤楠的新芽为红色或者淡红色，叶子比较尖细，但黄杨的嫩芽通常为绿色，叶片顶端比较圆润，质地非常厚实。
2、枝干形态
赤楠和黄杨的枝干形态有差别，赤楠的枝干呈干枯状态，表皮颜色为灰白色，而黄杨的树干和分枝更加枯黄，整个植株呈现一种干瘪发皱的现象。
3、功能用途
赤楠在生长过程中嫩芽不断抽发，有很好的观赏效果，黄杨的树姿优美，叶片一年四季常青，可以终年观赏，并且黄杨还能用于园林以及木雕。
4、养殖方法
赤楠和黄杨在生长期间对水分的需求较高，在养殖时要多往土壤中灌水，并且雨季要挖沟将积水排出，另外赤楠和黄杨的枝叶繁茂，要勤修剪，将过长的枝条剪掉。
